TCGA 泛癌分析
参考 GEPIA / TCGAplot 的在线分析:输入基因,查看 33 种 TCGA 癌种(PanCancer Atlas)中的
表达分布、生存预后、基因相关性与分期表达。基于本地同步的 TCGA PanCancer Atlas 数据(33 癌种),即查即出。
免费工具,仅供科研参考。
💡 试试:TP53(表达 / 生存)、STAT1、CD8A;相关性试试 CD8A × GZMB
① 多癌种表达
② 生存分析
③ 基因相关性
④ 分期表达
⑤ 多基因比较
⑥ 跨癌种热图
⑦ 相关矩阵
⑧ 基因集 ssGSEA 生存
⑨ 免疫热图
⑩ TMB/MSI
⑪ 分组比较
⑫ 免疫浸润
⑬ 免疫评分
⑭ 配对比较
⑮ 甲基化
结果:Kaplan-Meier 曲线(按表达量分组)
输入基因集(ssGSEA 评分 → 生存 KM)
评分:ssGSEA(秩加权 ECDF 面积,α=0.25)在所选癌种的肿瘤样本内计算,再按所选分组方式画 KM;基因建议 5–50 个,取 3–20 秒
输入基因(基因 × 免疫相关基因集相关热图,32 癌种)
结果:免疫相关基因相关热图(*p<0.05 **p<0.01 ***p<0.001)
输入基因(表达 × TMB / MSI 泛癌相关雷达图)
输入基因(表达 × 22 种免疫细胞浸润相关,CIBERSORT)
结果:免疫细胞相关(*p<0.05 **p<0.01 ***p<0.001)
输入基因(表达 × ESTIMATE 免疫评分相关)
输入基因(表达 × 启动子甲基化散点)
⚠ 仅覆盖有启动子探针注释的基因(约 1 万个);无探针的基因会提示